Die Ausstellung gliedert sich in die Bereiche Stadtgeschichte, Seefahrt, Fischerei sowie Vor- und Frühgeschichte. Hervorzuheben sind die Schiffsmodelle, Schiffsporträts, Navigationsinstrumente sowie die Fossilienfunde vom "Hohen Ufer". Ein Porträt von Theodor Storm, Fotos und Dokumente erinnern an dessen Beziehungen zu Heiligenhafen und an die Entstehung der Novelle "Hans und Heinz Kirch".